题目描述
小 A 最近一直在找自己的爸爸,用什么办法呢,就是 DNA 比对。
小 A 有一套自己的 DNA 序列比较方法,其最终目标是最大化两个 DNA 序列的相似程度,具体步骤如下:
- 给出两个 DNA 序列,第一个长度为 $n$,第二个长度为 $m$。
- 在两个序列的任意位置插入任意多的空格,使得两个字符串长度相同。
- 逐位进行匹配,如果两个序列相同位置上的字符都不是空格,假设第一个是 $x$,第二个是 $y$,那么他们的相似程度由 $d(x,y)$ 定义。对于两个序列中任意一段极长连续空格,设其长度为 $k$,我们定义这段空格的相似程度为 $g(k)=-A-B\times (k-1)$,其中 $A,B$ 均为正整数。
那么最终两个序列的相似程度就是所有的 $d(x,y)$ 加上所有的极长空格段的相似程度之和。
现在小 A 通过某种奥妙重重的方式得到了小 B 的 DNA 序列中的一段,他想请你帮他算一下小 A 的 DNA 序列和小 B 的 DNA 序列的最大相似程度。
输入格式
输入第 $1$ 行一个字符串,表示小 A 的 DNA 序列。
输入第 $2$ 行一个字符串,表示小 B 的 DNA 序列。
接下来 $4$ 行,每行 $4$ 个整数,用空格隔开,表示 $d$ 数组,具体顺序如下所示。
$d(A,A)$ $d(A,T)$ $d(A,G)$ $d(A,C)$
$d(T,A)$ $d(T,T)$ $d(T,G)$ $d(T,C)$
$d(G,A)$ $d(G,T)$ $d(G,G)$ $d(G,C)$
$d(C,A)$ $d(C,T)$ $d(C,G)$ $d(C,C)$
最后一行两个用空格隔开的正整数 $A,B$,意义如题中所述。
输出格式
输出共一行,表示两个序列的最大相似程度。
样例
input
ATGG
ATCC
5 -4 -4 -4
-4 5 -4 -4
-4 -4 5 -4
-4 -4 -4 5
2 1
output
4
首先,将序列补成如下形式(-
代表空格)
ATGG--
AT--CC
然后所有 $d(x,y)$ 的和为 $d(A,A)+d(T,T)=10$,所有极长连续空格段的相似程度之和为 $g(2)+g(2)=-6$。总和为 $4$,可以验证,这是相似程度最大的情况。
数据范围与提示
对于所有测试点,有 $0< B<A \le 1000, -1000\le d(x,y)\le 1000,d(x,y)=d(y,x)$,序列只包含 ${\text{A},\text{T},\text{G},\text{C}}$ 四种字符。
测试点编号 | $n + m$ 的范围 | 特殊约定 |
---|---|---|
1 | $n = m = 1$ | 无特殊要求 |
2 | $n + m \leq 15$ | 无特殊要求 |
3 | $n + m \leq 300$ | 无特殊要求 |
4 | $n + m \leq 300$ | 无特殊要求 |
5 | $n + m \leq 3000$ | 序列中只包含一种字符 |
6 | $n + m \leq 3000$ | 无特殊要求 |
7 | $n + m \leq 3000$ | 无特殊要求 |
8 | $n + m \leq 3000$ | 无特殊要求 |
9 | $n + m \leq 3000$ | 无特殊要求 |
10 | $n + m \leq 3000$ | 无特殊要求 |
来自 CodePlus 2017 11 月赛,清华大学计算机科学与技术系学生算法与竞赛协会 荣誉出品。
Credit:idea/邢健开 命题/邢健开 验题/陈宇
Git Repo:https://git.thusaac.org/publish/CodePlus201711
感谢腾讯公司对此次比赛的支持。